تأسست كلية العلوم مع تأسيس جامعة النهرين في عام 1988 وضمت في بادئ الأمر ثلاث أقسام فقط هي قسم الكيمياء وقسم الفيزياء وقسم الحاسبات. وفي أوائل لعام الدراسي 1991 1992 تم إستحداث "قسم ا لرياضيات وتطابيقات الحاسوب" وفي عام 1994 تم أستحداث قسم التقانة الاحيائية لتصبح كلية العلوم تضم خمسة اقسام تمنح شهادة البكالريوس و الماجستير و الدكتوراة